El xifratge per dígrafs encripta substituint cada parella de lletres del missatge per un dígraf diferent o un símbol. En aquest exemple, cada dígraf del text net és substituït per un dígraf del quadrat. Per exemple, per encriptar "JO", hem de trobar la intersecció de la columna "J" i fila "O", d'on resulta "WR". Aquest és molt més difícil de desxifrar que un xifratge de lletres soles, perquè el descodificador ha d'identificar el valor de 676 dígrafs, oposat a les 26 substitucions de lletres.